Η προστασία και η ανάδειξη της βιοποικιλότητας σε αρχαιολογικούς χώρους της χώρας, σε άμεση συνάρτηση με την πολιτιστική τους κληρονομιά, αποτελεί το αντικείμενο της νέας Προγραμματικής Σύμβασης Πολιτισμικής Ανάπτυξης «Βιοποικιλότητα στους Αρχαιολογικούς Χώρους – ΒΙΑΣ ΙΙ».η Κνωσός και η Γόρτυνα, στην Κρήτη η Βεργίνα, στην Ημαθία η Αμφίπολη, στις Σέρρες η Μονεμβασιά και το Κάστρο Γερακίου, στη Λακωνία οι Πηγές Αγγίτη, στη Δράμα το Δίον, στην Πιερία, καθώς και σε σημαντικούς νησιωτικούς χώρους όπως, το Καστελλόριζο, το Αγαθονήσι, η Νέα Μονή Χίου και το Ηραίο Σάμου.
